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What is DaniWeb IT Discussion Community?
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Newbie Poster
I am totally new in biopython and its my first program.so may be i am asking stupid question.
I am working with a text filelooks like this:
#NAME AA TOPO ACCESS DSSP STRIDE Z-COORD
1lghB A i 79.8 H H -24.58
1lghB V i 79.6 H H -22.06
1lghB H i 71.9 H H -19.94
i need to compare those lines which has a value between 10 to 22 and presents in the following way
True/false A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W(here alfabets represents amino acids)
1 1:1 2:0 3:0 and so on for rest of the amino acids.
I have given 2 examples below to make it clear a bit:
ex.1:
#NAME AA TOPO ACCESS DSSP STRIDE Z-COORD
1lghB A i 79.8 H H -24.58 #for that line amino acid is A and z-COORED value is more than 22,so output should be look like
True/false A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W(here alfabets represents amino acids)
-1 1:1 2:0 3:o 4:0 so on upto 20 bcz there r 20 amino acids.and A presents in the 1st position.every line represents one amino acid with value,so output will show in which position is it(here A is in 1st position thats why its value 1:1 and all the other position o like 2:0,3:0,4:0 and if its Z-COORED value between 10-22 then true false value 1,otherwise -1.
another ex:
1lghB H i 71.9 H H -19.94 # for that line amino acid is H and it has value between 10-22.so output should looks like:
True/false A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W(here alfabets represents 20 amino acids)
1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:1 8:0,every position is zero up to 20 bcz H presents in the 7th position.so it will be 1.
so for every line, output will in 21 coulum,1st coulum for true false value,others r for 20 amino acids.true false value will be either 1 or -1,and within other 20 coulum one value will be n:1,others will be n:0.n=0,1,2,3..20.
its a bit tricky.
thank u so much for ur help in advance
waiting for ur opinion.
I am working with a text filelooks like this:
#NAME AA TOPO ACCESS DSSP STRIDE Z-COORD
1lghB A i 79.8 H H -24.58
1lghB V i 79.6 H H -22.06
1lghB H i 71.9 H H -19.94
i need to compare those lines which has a value between 10 to 22 and presents in the following way
True/false A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W(here alfabets represents amino acids)
1 1:1 2:0 3:0 and so on for rest of the amino acids.
I have given 2 examples below to make it clear a bit:
ex.1:
#NAME AA TOPO ACCESS DSSP STRIDE Z-COORD
1lghB A i 79.8 H H -24.58 #for that line amino acid is A and z-COORED value is more than 22,so output should be look like
True/false A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W(here alfabets represents amino acids)
-1 1:1 2:0 3:o 4:0 so on upto 20 bcz there r 20 amino acids.and A presents in the 1st position.every line represents one amino acid with value,so output will show in which position is it(here A is in 1st position thats why its value 1:1 and all the other position o like 2:0,3:0,4:0 and if its Z-COORED value between 10-22 then true false value 1,otherwise -1.
another ex:
1lghB H i 71.9 H H -19.94 # for that line amino acid is H and it has value between 10-22.so output should looks like:
True/false A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W(here alfabets represents 20 amino acids)
1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:1 8:0,every position is zero up to 20 bcz H presents in the 7th position.so it will be 1.
so for every line, output will in 21 coulum,1st coulum for true false value,others r for 20 amino acids.true false value will be either 1 or -1,and within other 20 coulum one value will be n:1,others will be n:0.n=0,1,2,3..20.
its a bit tricky.
thank u so much for ur help in advance
waiting for ur opinion.
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Posting Pro
It is a bit tricky. Can you explain the problem more precisely? For example, what do each of the fields in the string
"1lghB H i 71.9 H H -19.94"
mean?
Jeff
"1lghB H i 71.9 H H -19.94"
mean?
Jeff
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Newbie Poster
I am working with a text filelooks like this:
#NAME AA TOPO ACCESS DSSP STRIDE Z-COORD
1lghB A i 79.8 H H -24.58
1lghB V i 79.6 H H -22.06
1lghB H i 71.9 H H -19.94
i need to compare those lines which has a value between 10 to 22 and presents in the following way
True/false A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W(here alfabets represents amino acids)
1 1:1 2:0 3:0 and so on for rest of the amino acids.
I have given 2 examples below to make it clear a bit:
ex.1:
#NAME AA TOPO ACCESS DSSP STRIDE Z-COORD
1lghB A i 79.8 H H -24.58 #for that line amino acid is A and z-COORED value is more than 22,so output should be look like
True/false A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W(here alfabets represents amino acids)
-1 1:1 2:0 3:o 4:0 so on upto 20 bcz there r 20 amino acids.and A presents in the 1st position.every line represents one amino acid with value,so output will show in which position is it(here A is in 1st position thats why its value 1:1 and all the other position o like 2:0,3:0,4:0 and if its Z-COORED value between 10-22 then true false value 1,otherwise -1.
another ex:
1lghB H i 71.9 H H -19.94 # for that line amino acid is H and it has value between 10-22.so output should looks like:
True/false A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W(here alfabets represents 20 amino acids)
1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:1 8:0,every position is zero up to 20 bcz H presents in the 7th position.so it will be 1.
so for every line, output will in 21 coulum,1st coulum for true false value,others r for 20 amino acids.true false value will be either 1 or -1,and within other 20 coulum one value will be n:1,others will be n:0.n=0,1,2,3..20.
its a bit tricky.
I have done something so far about that problem,but its not the good way to
do it
need ur comments about that....
from string import *;
import sys
myfile = open("/afs/pdc.kth.se/home/d/debnath/membrane/1a91A.txt")
a = myfile.readlines()
data = myfile.readlines()
for line in myfile.readlines():
fields = line.split('\t')
items=fields.strip()
list1.append(items[1])
for i in Z-CORRED:
if 10.0 <= z <= 22.0:
matches.append([1,i])
else:
matches.append([-1,i])
print "#T/F A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W X Y
Z"
for a in range(0,len(matches),1):
if matches[a][0]==1:
if matches[a][1]=='A':
print "1 1:1 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0
14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='C':
print "1 1:0 2:1 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0
14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='D':
print " 1 1:0 2:0 3:1 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
""" if matches[a][1]=='E' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:1 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='F' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:1 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='G' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:1 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='H' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:1 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='I' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:1 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='K' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:1 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='L' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:1 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='M' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:1 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='N' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:1
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='P' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:1 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='Q' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:1 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='R' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:1 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='S' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:1 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='T' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:1 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='V' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:1 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='X' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:1 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='Y' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:1 21:0"
if matches[a][1]=='Z' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:1"
"""
else:#here i have getting comments
if matches[a][1]=='A':
print "-1 1:1 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0
14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='C':
print "-1 1:0 2:1 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='D':
print " 1 1:0 2:0 3:1 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
""" if matches[a][1]=='E' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:1 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='F' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:1 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='G' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:1 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='H' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:1 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='I' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:1 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='K' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:1 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='L' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:1 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='M' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:1 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='N' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:1
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='P' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:1 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='Q' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:1 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='R' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:1 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='S' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:1 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='T' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:1 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='V' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:1 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='X' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:1 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='Y' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:1 21:0"
if matches[a][1]=='Z' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:1"
waiting for ur opinion.
thanks
#NAME AA TOPO ACCESS DSSP STRIDE Z-COORD
1lghB A i 79.8 H H -24.58
1lghB V i 79.6 H H -22.06
1lghB H i 71.9 H H -19.94
i need to compare those lines which has a value between 10 to 22 and presents in the following way
True/false A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W(here alfabets represents amino acids)
1 1:1 2:0 3:0 and so on for rest of the amino acids.
I have given 2 examples below to make it clear a bit:
ex.1:
#NAME AA TOPO ACCESS DSSP STRIDE Z-COORD
1lghB A i 79.8 H H -24.58 #for that line amino acid is A and z-COORED value is more than 22,so output should be look like
True/false A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W(here alfabets represents amino acids)
-1 1:1 2:0 3:o 4:0 so on upto 20 bcz there r 20 amino acids.and A presents in the 1st position.every line represents one amino acid with value,so output will show in which position is it(here A is in 1st position thats why its value 1:1 and all the other position o like 2:0,3:0,4:0 and if its Z-COORED value between 10-22 then true false value 1,otherwise -1.
another ex:
1lghB H i 71.9 H H -19.94 # for that line amino acid is H and it has value between 10-22.so output should looks like:
True/false A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W(here alfabets represents 20 amino acids)
1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:1 8:0,every position is zero up to 20 bcz H presents in the 7th position.so it will be 1.
so for every line, output will in 21 coulum,1st coulum for true false value,others r for 20 amino acids.true false value will be either 1 or -1,and within other 20 coulum one value will be n:1,others will be n:0.n=0,1,2,3..20.
its a bit tricky.
I have done something so far about that problem,but its not the good way to
do it
need ur comments about that....
from string import *;
import sys
myfile = open("/afs/pdc.kth.se/home/d/debnath/membrane/1a91A.txt")
a = myfile.readlines()
data = myfile.readlines()
for line in myfile.readlines():
fields = line.split('\t')
items=fields.strip()
list1.append(items[1])
for i in Z-CORRED:
if 10.0 <= z <= 22.0:
matches.append([1,i])
else:
matches.append([-1,i])
print "#T/F A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W X Y
Z"
for a in range(0,len(matches),1):
if matches[a][0]==1:
if matches[a][1]=='A':
print "1 1:1 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0
14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='C':
print "1 1:0 2:1 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0
14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='D':
print " 1 1:0 2:0 3:1 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
""" if matches[a][1]=='E' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:1 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='F' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:1 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='G' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:1 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='H' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:1 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='I' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:1 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='K' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:1 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='L' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:1 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='M' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:1 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='N' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:1
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='P' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:1 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='Q' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:1 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='R' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:1 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='S' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:1 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='T' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:1 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='V' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:1 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='X' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:1 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='Y' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:1 21:0"
if matches[a][1]=='Z' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:1"
"""
else:#here i have getting comments
if matches[a][1]=='A':
print "-1 1:1 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0
14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='C':
print "-1 1:0 2:1 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='D':
print " 1 1:0 2:0 3:1 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
""" if matches[a][1]=='E' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:1 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='F' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:1 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='G' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:1 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='H' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:1 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='I' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:1 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='K' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:1 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='L' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:1 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='M' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:1 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='N' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:1
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='P' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:1 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='Q' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:1 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='R' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:1 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='S' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:1 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='T' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:1 18:0 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='V' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:1 19:0 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='X' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:1 20:0 21:0"
if matches[a][1]=='Y' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:1 21:0"
if matches[a][1]=='Z' and matches[a][0]==1:
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0
13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:1"
waiting for ur opinion.
thanks
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Posting Whiz
It's late and I'm tired but this is the general idea if I understand correctly This is what doesn't make sense to me And I don't understand all of the print statements. But first, verify that this is the correct way to split the data. Then figure how to store/print it. HTH.
data=["1lghB A i 79.8 H H -24.58",
"1lghB V i 79.6 H H -22.06",
"1lghB H i 71.9 H H -19.94"]
for line in data:
print "\nlooking at", line
substrs=line.strip().split()
print "amino acid =", substrs[1], "and value =", substrs[-1]
value = abs(float(substrs[-1]))
if 9.99 < value < 22.01:
print "greater than 10 and less than 22"
#
# And if you want to keep track of how many hits are found for each
# amino, I would suggest a dictionary with the amino acid symbol
# as key, containing a simple integer counter, so adding to a
# dictionary the simplest way is:
# (This is still under the if statement)
if substrs[1] in amino_dic:
amino_dic += 1
else:
amino_dic[substrs[1]]=1## what is Z_CORRED ## and you don't define z for i in Z-CORRED: if 10.0 <= z <= 22.0: matches.append([1,i])
Last edited by woooee : Apr 10th, 2008 at 10:38 pm.
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Posting Whiz
And the last part should read (I said I was tired) Don't understand this statement but it can also be handled with a dictionary of lists, instead of your list of lists.
symbol=substrs[1] ## not necessary but easier to read
if symbol in amino_dic:
amino_dic[symbol] += 1
else:
amino_dic[symbol]=1•
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output will in 21 column,1st column for true false value,others r for 20 amino acids.true false value will be either 1 or -1,and within other 20 coulum one value will be n:1,others will be n:0.n=0,1,2,3..20
if symbol not in amino_dic:
amino_dic[symbol]=[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,]
amino_dic[symbol] = add one to proper list element Last edited by woooee : Apr 10th, 2008 at 10:50 pm.
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True/false A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W(here alfabets represents 20 amino acids)
out put had to be in 21 coulum in the above order.If the z-coored between 10-22 that true/false will be 1,otherwise -1.every row will work only for one amino acid,
1lghB H i 71.9 H H -19.94 # for that line amino acid is H and it has value between 10-22.so output should looks like:
True/false A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W(here alfabets represents 20 amino acids)
1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:1 8:0,every position is zero up to 20 bcz H presents in the 7th position.so it will be 1.true false 1 bcz its is in 10-22 range.
thanks for ur help!but still its not printing.....
waiting for ur opinion.
out put had to be in 21 coulum in the above order.If the z-coored between 10-22 that true/false will be 1,otherwise -1.every row will work only for one amino acid,
1lghB H i 71.9 H H -19.94 # for that line amino acid is H and it has value between 10-22.so output should looks like:
True/false A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W(here alfabets represents 20 amino acids)
1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:1 8:0,every position is zero up to 20 bcz H presents in the 7th position.so it will be 1.true false 1 bcz its is in 10-22 range.
thanks for ur help!but still its not printing.....
waiting for ur opinion.
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I saw this solved on another forum. No on wants to waste their time on threads that may have already been solved on another forum. For the future, cross-posted threads will generally get no response.
Last edited by woooee : Apr 13th, 2008 at 11:50 am.
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okay!
the problem is it is not solved yet.
waiting for ur opinion.
how to define z-coored?
the problem is it is not solved yet.
waiting for ur opinion.
how to define z-coored?
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from string import *;
import sys
myfile = open("/afs/pdc.kth.se/home/d/debnath/membrane/1a91A.txt")
print "#T/F A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W X Y Z"
Z-COORED=[]
for lines in myfile:
fields = lines.strip()
items = fields.split()
for i in Z-COORED:
if 10.0 <= float(fields[6]) <= 22.0: # Sets T/F flag
matches.append([1,i])
else:
matches.append([-1,i])
handle = open("/afs/pdc.kth.se/home/d/debnath/membrane/result1","w")
print "#T/F A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W"
for a in range(0,len(matches),1):
if matches[a][1]=='A' :
print " 1 1:1 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='C':
print " 1 1:0 2:1 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='D':
print " 1 1:0 2:0 3:1 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='E':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:1 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='F':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:1 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='G':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:1 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='H':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:1 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='I':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:1 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='K':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:1 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='L':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:1 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='M':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:1 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='N':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:1 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='P':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:1 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='Q':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:1 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='R':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:1 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='S':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:1 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='T':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:1 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='V':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:1 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='X':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:1 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='Y':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:1 21:0"
elif matches[a][1]=='W':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:1"
else:
if matches[a][1]=='A' :
print "-1 1:1 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='C':
print "-1 1:0 2:1 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='D':
print "-1 1:0 2:0 3:1 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='E':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:1 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='F':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:1 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='G':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:1 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='H':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:1 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='I' :
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:1 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='K':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:1 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='L':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:1 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='M':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:1 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='N':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:1 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='P':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:1 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='Q':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:1 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='R':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:1 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='S':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:1 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='T':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:1 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='V':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:1 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='X':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:1 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='Y':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:1 21:0"
elif matches[a][1]=='W':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:1"
i have done that much but how can i define z-coored?its not working
thanks!
import sys
myfile = open("/afs/pdc.kth.se/home/d/debnath/membrane/1a91A.txt")
print "#T/F A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W X Y Z"
Z-COORED=[]
for lines in myfile:
fields = lines.strip()
items = fields.split()
for i in Z-COORED:
if 10.0 <= float(fields[6]) <= 22.0: # Sets T/F flag
matches.append([1,i])
else:
matches.append([-1,i])
handle = open("/afs/pdc.kth.se/home/d/debnath/membrane/result1","w")
print "#T/F A C D E F G H I K L M N P Q R S T V X Y W"
for a in range(0,len(matches),1):
if matches[a][1]=='A' :
print " 1 1:1 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='C':
print " 1 1:0 2:1 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='D':
print " 1 1:0 2:0 3:1 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='E':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:1 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='F':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:1 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='G':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:1 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='H':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:1 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='I':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:1 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='K':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:1 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='L':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:1 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='M':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:1 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='N':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:1 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='P':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:1 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='Q':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:1 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='R':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:1 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='S':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:1 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='T':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:1 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='V':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:1 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='X':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:1 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='Y':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:1 21:0"
elif matches[a][1]=='W':
print " 1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:1"
else:
if matches[a][1]=='A' :
print "-1 1:1 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='C':
print "-1 1:0 2:1 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='D':
print "-1 1:0 2:0 3:1 4:0 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='E':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:1 5:0 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='F':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:1 6:0 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='G':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:1 7:0 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='H':
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:1 8:0 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='I' :
print "-1 1:0 2:0 3:0 4:0 5:0 6:0 7:0 8:1 9:0 10:0 11:0 12:0 13:0 14:0 15:0 16:0 17:0 18:0 19:0 20:0 21:0"
elif matches[a][1]=='K':
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elif matches[a][1]=='L':
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elif matches[a][1]=='M':
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elif matches[a][1]=='N':
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elif matches[a][1]=='P':
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i have done that much but how can i define z-coored?its not working
thanks!
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